威宁绵羊和贵州半细毛羊FecB 基因SNP 分析

    • 摘要: 利用威宁绵羊和贵州半细毛羊构建DNA 池,设计11 对引物扩增其FecB 基因外显子和部分内含子的序列,对纯化后的PCR 产物双向测序,分析确定多态性位点。然后利用生物信息学软件分析SNPs 位点对FecB 基因RNA 二级结构、FecB 蛋白结构的影响。结果显示,在扩增的FecB 基因中筛选到10 个SNPs,其中exon5-A39G、exon9-C37A、exon11-C87A、intron2-A62G、intron4-A1023G、intron10-G24A 突变为威宁绵羊和贵州半细毛羊中所共有,而exon9-A8G 和intron1-G243A 突变为威宁绵羊所特有,intron3-G177A 和exon8-T86C 突变为贵州半细毛羊所特有。上述的SNPs 中,exon5-A39G 和exon9-A8G 为错义突变,exon5-A39G 突变导致编码的异亮氨酸(Ile)变为缬氨酸(Val),exon9-A8G 突变导致编码的天冬酰胺(Asn)变为天冬氨酸(Asp); exon9-C37A 和exon11-C87A 多态位点均未改变氨基酸的编码,为同义突变。

       

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