文昌鸡线粒体DNA控制区序列遗传多样性分析
Genetic diversity of mitochondrial DNA D-loop sequences of Hainan Wenchang chicken
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摘要: 运用PCR产物直接测序的方法对海南省文昌市90只文昌鸡样品的线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)第I高变区序列进行了分析.用CLUSTALX1.81软件进行序列比较,其中38只个体共检测到27个核苷酸多态位点,全部为转换无颠换,序列突变率为5.29%.用DnaSP软件估计出序列存在16个单倍型,单倍型多样度(Hd)为0.935.核苷酸多样度(π)为0.01479,平均核苷酸差异数(k)为7.541.运用Mega4.0软件计算出不同个体间的遗传距离,并据此构建了NJ系统树.文昌鸡样品在NJ无根树上聚为4大分支.研究结果表明,文昌鸡群体内个体序列变异程度较大,遗传多样性丰富,揭示文昌鸡在遗传组成上具有4个母系来源.
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